1955年5月25日内蒙古人民政府在呼和浩特市召开了第一次全区中医、蒙医代表大会。会议共收到各种提案231件，对落实党的中医政策和民族医药政策，改进中蒙医工作，提出了多方面的意见和建议。为自治区中蒙医工作顺利开展奠定了基础。

    1956年成立内蒙古医学院中蒙医系、1986年和1987年经自治区政府批准先后建立了内蒙古呼伦贝尔蒙医学校和内蒙古蒙医学院。

    1959年成立内蒙古中蒙医学会、1978年分别成立内蒙古中医学会和内蒙古蒙医学会，1998年更名为内蒙古中医药学会和内蒙古蒙医药学会。

    1960年内蒙古自治区人民委员会颁发了《内蒙古自治区中蒙医(药)带徒弟办法》，于1963年进行了修订。对学徒条件、学习内容、期限、手续、生活待遇、出师考试等都作了明确规定。

    1974年《蒙医药》、《内蒙古中医药》杂志创刊，1991年《蒙医药》杂志汉文版创刊、为交流中蒙医学术思想、探讨临床经验，普及中蒙医药知识发挥了作用。1995年《中国民族医药杂志》在呼和浩特创刊。成为我国唯一一家国家民族医药杂志。

    1982年9月在呼和浩特市召开了"全区中蒙医院暨民族卫生工作会议"，传达了衡阳会议精神、就中蒙医院如何突出特色问题进行了讨论。会后根据《全国中医医院工作条例》整顿了各级中蒙医医院。

    1984年4月制定了《蒙医医院工作条例》和《蒙医病历书写格式》，并在全国试行。

    1986年和2002年先后完成《医学百科全书?蒙医分卷》、《中华本草?蒙药分卷》的编撰工作。

    1990年国家中医药管理局在内蒙古中蒙医院建立了"国家蒙医培训基地"和"国家蒙药制剂中心"。1986年成立内蒙古自治区蒙药厂。是自治区最大的蒙药制药厂。

    1994年制定了《内蒙古自治区中蒙医继续医学教育实施方案》，并在全区实施。

    1994年内蒙古医学院开始培养蒙医学硕士研究生、为全国培养输送了一批高级蒙医药人才。2002年内蒙古民族大学蒙医药学院也开始培养蒙医药学硕士研究生。

    1995年制定了《内蒙古自治区中蒙医科研工作管理办法及2010年发展规划》、《内蒙古自治区蒙医医院住院病历检查评分标准与方法》、《内蒙古自治区专科专病领先学科实施方案》。有力地促进了中蒙医科研、临床研究工作。

    1998年内蒙古自治区中蒙医院被列入首批全国"百佳医院"行列，1999年在全区范围内开展评选"内蒙古自治区百佳医院"活动，有11所中蒙医院荣获自治区级"百佳医院"称号。

    1999年9月蒙医执业医师考试全国统考开始实施。

    2001年2月《内蒙古自治区蒙医中医条例》正式颁布，标致着中蒙医事业步入法制化轨道。2002年3月条例实施一周年之际，在全区范围内进行了条例贯彻落实情况督察工作，并根据条例有关规定、在过去没有设立中蒙医科的巴盟、包头、通辽市设立了中蒙医科。

    2001年8月在呼和浩特市召开了2001国际蒙医药学术大会。卫生部张文康部长、国家中医药管理局李振吉副局长、内蒙古自治区乌云其木格主席以及有关部门领导出席了开幕式。此次大会为推动我区与国内外蒙医药学术交流与合作起到了积极的作用。