西医对于人体的研究，采取从整体出发，也就是抛开表面然后打开人体的研究方法，一步一步向内深入研究结构，在结构的基础上探索人体功能，是一个逐渐深入微观领域的过程，可以说收获颇多，似乎远远超越了中医对于人体的认识。但是，对于只有在整体层次上才能出现的功能，比如感觉意识，就采取了放置一旁的方法。

    人体是一个复杂的有机体，以结构求功能也存在不少不完善的地方。

    首先是，器官解剖虽然形态不同，也有明显不同的分工，但是，相互之间并不完全独立。肺脏非呼吸功能的发现，就打破了器官解剖的界限。也就是细胞学研究发现，肺泡和支气管有许多不同形态的细胞组成，而不是单一的“肺细胞”。各种上皮细胞，再加上肺间质之中的细胞，共有十几种之多，使肺脏除了呼吸功能之外，还具有免疫调节、内分泌代谢、水电解质平衡、心脏血流调节等一系列的功能。肺脏的疾病可以影响全身，身体其他部位的疾病也可以影响肺脏，它已经不能用单一的“脏器解剖”概念来解释了。其他的实质脏器也与此相似，心的非循环功能、肾的非排尿功能随着研究的不断深入，将会有更多的发现。反中医人士以器官解剖的精确性，说中医“不具备谈论人的资格”显然是拿盖伦时代的器官解剖知识，来评价中医，是落后的观念。

    以结构推测功能，在细胞层面上还勉强说得过去，因为不同器官、组织的细胞还有明显的区别。但是，当深入到细胞内的时候，就出现了与“以结构求功能”方法愿望相反的结果，所有的细胞核都含有同样的基因，不同细胞之间细胞核的区别不见了。不同细胞只是细胞整体功能的一个分工，而不是不同细胞的基因结构不同。也就是说，不同细胞所以功能不同，是因为基因调控过程之中，某些基因经常处于工作状态，而大部分基因并不工作。

    细胞基因的这个特点，充分说明了生命是整体生成的，而不是分步合成的，不是局部决定整体，而是局部可以影响整体。局部的特征，在整体上不一定有所表现，而整体特征是整个生命体外在的表征，是整合了各不同层面的微观变化之后所表露出来的状态。

    中医学对于人体的研究，虽然采取的是研究人体外在的生理、病理变化的方法，但是中医对于人体内部结构、生理功能，也有比较深入的了解。当然这种了解是器官水平的了解，而不是细胞水平的研究。也就是说，中医的脏腑“实有其物”而非凭空杜撰。而且五官九窍、皮毛、肌肉、血脉、骨骼都是客观实在；饮食、水液、呼吸、气血，确实存在“升降出入”的运动形式。