加强学科制度建设较之学术建设更为重要，它是学术发展的重要保障。这就需要良好的社会支撑体系。在期待有关领导对中医学基础学科的重视和社会各部门的支持的同时，作为中医基础医学专业人员，我们不应该单纯埋怨社会的冷落，而首先要反问自己是否真正理解“基础”的价值，是否已被它的魅力所吸引。对某些缺失，我们不应该沉默，更不应该无所作为，我们必须和其他广大自然科学和社会科学家一起，共同纠正这些缺失，在理解中全身心投入到中医学基础学科的建设之中，以自身的体验和实践，把认识到的生命特征的基础知识奉献给人类！
潘桂娟（中国中医研究院基础理论研究所）：古典中医学的思想理论精华，是现代中医学理论创新和实践创新的活水源头。中医学要在与现代科学文化的联系与交流中保持自己的风格与特色、生命力与影响力，并为人类的卫生保健事业作出独特贡献，就必须重视自身基本理论和诊疗思想的启迪，就必需尊重、发掘、继承、阐释并运用自己的基本理论和诊疗思想。当前，中医学科理论建设的首要任务，是对历代中医学原著的理论内涵进行全面的梳理。在此过程中，应注意从现代思维科学角度，解析自身理论形成与发展过程中的结构性弱点，探讨近现代思维科学方法、逻辑科学方法对于中医学理论体系整体提高和现代表述的借鉴意义和作用。如何在保持中医学理论系统思维特色、优势的基础上，通过学科理论建设克服中医学理论结构上的内在弱点，并对理论概念与内涵进行现代规范性语言表述，使之更便于理解、掌握、传承、发展、交流，是中医学科理论建设必须面对和解决的问题。其次，中医学有着长期的学术积淀，记载于历代各家著述以及现代研究之中，至今未能从理论上得到系统总结和研究，我们应该从提炼历史积淀、概括现代发展两方面对中医理论进行系统综合。再次是要对中医理论进行阐发。中医学植根于中国传统文化，包涵了丰富的人文、哲学内涵，而思维方式是文化结构的内核，是某一种特定文化的真正生命力所在。因此要理解中医学理论的本质、特征，必须认真研究中医学理论的思想基础，把中医学理论放到中国传统文化的背景下加以认真研究和解析，全面阐发中医学理论的思想文化基础，探索中医学理论起源和发展的规律，实事求是地总结和正确认识“中医学理论从何而来”的根本问题。中医学的思维方式，是中国传统文化思维方式的具体体现。中医理论阐发，最重要的是对中医学理论思维的阐发。由于种种原因，中医学理论的思维方式和思维方法模式，至今并未从思维科学的角度得到系统的研究和深刻的阐明，自然也难以在中医学术界得到普遍而深刻的认知，因而不仅影响到对中医学理论本质与特征的深层次把握，也直接影响到中医学理论的临床应用。研究中医学的思维方式，不仅关系到如何理解和对待过去的问题，而且更重要的是关系到如何创造未来的问题。
陆广莘（中国中医研究院基础理论研究所）：我认为中医学主体价值体系包含四个方面内容：①养生治病必求于本的中医诊疗思想；②天人合德、健康生态的目标医学模式；③人的生生之气自我健康能力和自我痊愈能力的中医基础理论；④辨证论治生生之道之功能目标动力学实践的专门方法论。中医学及其基础理论的学科建设，就是要坚持中医学主体价值体系，从长期把“证从属于病”的学术误区中解放出来，坚持人的整体性层次的主体性地位，自组演化调节的个体性和时间不可逆性；从长期以来现代教育中接受的关于物质科学的思维方法中超脱出来，用功能目的性行为看待医学行为现象；从长期以来致力于说明中医愈病之理的研究中医，转变为致力于发展中医生生之道实践能力的中医研究。同时，还要改变中医队伍主体缺失和角色错位，改变后继乏人乏学，这些都有待于中医基础理论学科建设的健康发展。
烟建华（北京中医药大学）：中医基础理论是在中国大地上由中华民族文化孕育的、经过先人艰苦漫长的医疗实践总结出来的、对于人生命活动规律的认识及其医学应用的知识与法则。研究中医基础理论的发展，应以把握其学术内涵、特点为基础和前提。
中医基础理论的发展应当走可持续发展之路，从大科学、大文化的视角和高度，辩证地认识中医理论在生命科学和医学科学中的地位、价值与缺陷，端正中医科研思路，处理好继承与创新的关系，将生物学基础的探索、人文科学的研究与综合方法、分析方法有机结合起来，在长期、深厚积累的基础上寻求突破口。
中医基础理论由形成到完善过程采用经典引申发展形式。这是一种学术贯通式的发展，其中经典所阐述的概念、原理、原则是源，是创新的基础；后世是流、是对原有理论的充实、发挥、系统与规范化，使原有理论不断深化和完善，鲜有推翻经典概念、理论、标新立异者。对于这种发展模式，人们普遍认为它束缚创造精神，是中医学发展迟缓、停滞的罪魁祸首。但它与中医理论学术内蕴相适应，在完成中医理论的系统化、规范化过程方面，在巩固和维护中医学术的自身特点方面，都发挥过重要作用。不仅如此，为了中医治病、提高疗效，为了深刻理解和掌握中医理论实质，进一步深化和完善中医理论，在一个相当长时期内还要运用这种形式。当然，真正意义上的中医理论发展，应当是一种改革、革新，对中医理论进行改造，发扬长处、弥补缺陷，在这种意义上，当然要对经典引申形式进行革命，以至于抛弃。
