首先，一个显而易见的原因是，“容易被开发”的产品都已经被发现了。没有人会否认，随着活性药靶成为一种开发目标，科学家们的工作已经变得日益困难。这种情况与频繁出现的耐抗生素药物之类的事件又交织在一起，从而对开发新药提出了更高的要求。

    另外一个原因是，从开发新技术中可能难以获取较高的回报。为了最大限度地提高生产量和生产率，从而在竞争日趋激烈的市场上占据优势，制药公司常常要在开发创新性新技术上冒很大的风险，即使日后看不到由此带来的回报。这方面的例子包括增加反义技术的使用，反义技术已被证明是一种成功的技术，尽管它没有达到制药行业所预期的较高标准。

    在立法方面，制药行业面临的限制越来越紧，使得开发新药并获得监管部门的批准更加困难。比如，原安万特公司研制的酮内酯类抗生素泰利霉素Ketek（telithromycin）的审批就被美国FDA推迟了几个月，FDA要求安万特公司提供更多的有关抗性菌株的数据。确实，COX-2抑制剂的失败对制药业产生了很大的震动，FDA随后采取的彻查方式就是为了确保提高新药的质量，以免重蹈覆辙。

    一个被认可的趋势是，制药公司可以通过在研发活动上投入更多的资金，并向外界寻求帮助（尤其是通过战略结盟），来努力提高生产效率。不过，尽管科学家们对这种合作的重要性予以认可，但75％接受调查的科学家仍然相信，制药公司应该把更多的注意力放在内部研发活动上，以提高自身的创新能力和生产率。

    风险控制在早期

    药物研发活动面临着各种挑战。只有30％的科学家相信，衡量生产效率的管理系统是有效的，而20％的科学家认为，工作程序效率的提高会发挥作用。大多数科学家（70％）将风险识别与控制视为研发活动所面临的最大挑战。

    史蒂夫.陈评论说，从事研发活动的部门似乎在识别和控制风险上正在做着乏味的工作，这是影响生产效率的一个关键因素，“一些不理想的项目没能马上终止，使得研发成本居高不下，从而白白浪费了本来可用于更有希望的项目上的资源。从事研发活动的部门或忽视或低估了研发所存在的风险，因此对他们来说，必须寻找到更好的办法，在开发周期的更早阶段即识别并剔除出那些不会带来任何希望的项目。”