贵州中药区划共分为下述7个一级中药区和17个中药亚区（二级区）；贵州省中药区划的分区系统及命名如下：
   
    Ⅰ 黔东北低山丘陵吴茱萸、朱砂、金银花、五倍子、枳壳、栀子中药区 

    本区含3个亚区，即铜仁一万山朱砂、吴茱萸、麦冬区；松桃一印江吴茱萸、白术、五倍于、金银花、枳壳区；沿河－思南吴茱萸、天麻、天冬、桅子、雄黄区。

    Ⅱ 黔东北低山丘陵吴茱萸、朱砂、金银花、五倍子、枳壳、栀子中药区 

    本区含3个亚区，即铜仁一万山朱砂、吴茱萸、麦冬区；松桃一印江吴茱萸、白术、五倍于、金银花、枳壳区；沿河－思南吴茱萸、天麻、天冬、桅子、雄黄区。

    Ⅲ 黔南山原山地河谷石斛、三七、艾纳香、通草、乌梅、砂仁中药区 
    本区含3个亚区，即平塘－独山麝香、南沙参、乌梅、仙茅、桔梗区；罗甸－望谟艾纳香、三七、砂仁、通草、木蝴蝶区；兴义－贞丰石斛、何首乌、灵芝、黄精、白及、姜黄区。

    Ⅳ 黔西高原山地厚朴、半夏、党参、龙胆、枳壳、黄芩中药区  

    本区含2个亚区，即水城－盘县厚朴、川牛膝、续断、枳壳、龙胆、倒提壶区；威宁党参、半夏、乌梅、山桃仁、秦艽、金铁锁区。
    Ⅴ 黔西北中山山地丘陵天麻、杜仲、半夏、龙胆、猪苓中药区  
本区含2个亚区，即毕节－赫章半夏、云木香、川牛膝、龙胆、天麻、猪苓区；金沙－黔西杜仲、石斛、金银花、五倍子、泽泻区。

    Ⅵ 黔北山原山地杜仲、黄柏、厚朴、天麻、金银花、续断、五倍子中药区 

    本区含3个亚区，即赤水一习水石斛、黄柏、杜仲、厚朴、木瓜、九香虫区；道真一正安杜仲、天麻、黄连、续断、桔梗、五倍子、云木香区；遵义－湄潭杜仲、金银花、白芍、吴茱萸、天冬、玄参、红花区。

    Ⅶ 黔中山原山地麝香、天麻、山药、鱼腥草中药区  

    本区合2个亚区，即贵阳－惠水麝香、天麻、草血竭、鱼腥草、南沙参区；安顺－开阳山药、杜仲、山茱萸、桔梗、五倍子区。

    通过中药区划与中药GAP的有机结合，将更有利于按市场机制配置中药生产与流通，利于市场预测，利于分区规划，分类指导及分级实施，以更好按照自然规律与经济规律办事，增添与丰富了中药学科的科学内涵。通过中药区划与中药GAP的有机结合，还可更加了解各区域的中药生产与中药资源特色，更加丰富了地道药材的科学内涵，以生态学与社会经济相结合的方法深入研究地道药材，深入研究中药品种，既增强了中药资源永续利用的责任感，也丰富与发展了中药品种新理论，以更有利于提高中药产业的科技水平。