有着悠久历史的中国传统医学虽然在理论体系和治疗方法上，与兴起于西方的现代医学有着很大的不同，但却蕴藏着许多朴素的辨证分析思想及系统论的观念。目前对中医药的研究日益得到国际上的重视，并出现了一些值得关注的新动向。西方实验医学长期以来把人体分割成许多独立部分，采取各个“击破”法，忽视了系统的整体特性，在肿瘤等慢性疾病研究方面难有根本性突破。而我国中医学蕴藏着系统论观念，强调从整体角度去认识和调节人体生命活动规律，但受技术手段限制也难有多大作为。新兴的系统生物医学的崛起为中医药融入世界提供新契机。越来越多大师级科学家正积极推进现代科学技术与中医系统论思想的结合。诺奖得主穆拉德在上海建立了中药现代化研究中心，运用系统生物医学的思路，推动对中药成分以及药理的研究。“代谢组学之父”、英国帝国理工大学教授杰里米?尼科尔森在上海系统生物医学国际研讨会上指出，代谢组学把人体作
    
    为一个完整的系统来研究，研究人体代谢网络在疾病和药物作用下的变化规律，这与中医中药的哲学思想完全吻合。代谢组学不但可以对药物进行毒理分析，还能在中药质量控制中发挥重要作用，代谢组学将成为中药实现突破、进入国际市场的强大工具。基于单个靶点的传统药物开发已走进“死胡同”，时间长达10－12年，耗资也从原先3－4亿美元增加到目前的8亿美元。药物开发需要新思维。今后，借助系统生物医学平台，可以加速药物发现和开发进程。指纹图谱是将中药融入系统生物医学框架下的中药研究工具。多成分、多靶点是中药作用机理的主要特征。对重大疾病开展细胞生物学和分子生物学研究，寻找中药主要疗效成分，主要作用靶点，以及对寻求对中药指纹图谱的科学表达，是促进中药现代化，促进中药国际化的必要手段。
         
    自晋代葛洪在《肘后备急要方》首次提出“成药”概念以来，中成药已有一千七百年历史。受科学技术条件的限制，中成药在成品内在质量的控制上缺乏检验的方法手段，可谓“丸散膏丹，神仙难辨”。中成药功效，主要依靠原料药材的地道性和药工制作的经验性予以保证。同仁堂“炮制虽繁，必不敢省人力；品味虽贵，必不敢减物力”的古训，集中反映了传统中成药生产保证质量的基点。虽然这种缺乏事后内在质量检验方法的状况，直到二十世纪六十年代徐国钧先生提出显微鉴别方法才发生变化。但由于传统中成药蜜丸、水丸、散剂等主要剂型都以药材饮片粉末为制剂主料，又是小生产状态，所以中药材的地道性、老药工的经验性，基本尚可保证成药功效。
         
    从二十世纪五十年代中叶起到现在，中成药从剂型工艺到生产方式发生了根本的变化。片剂、颗粒剂、口服液等现代剂型已取代“丸、散、膏、丹”占主体地位。制剂主料也由提取物取代原料粉。已有上百个中成药工业企业规模化、机械化，年产亿元以上，前三名达十亿元以上。与此同时，从一九五八年起，各地为解决需求供应短缺，广泛引种药材，许多药材地道性显著淡化。所有这些巨大变化都表明中成药生产质量稳定性的传统基础基本已不适应。中成药业和世界上一切产业发展过程一样，在由手工业小生产向工业大生产过渡的同时，其产品质量也必须实现由凭过程经验控制到事后检验控制的过渡。时至今日，中成药功效的稳定性，已到必须建立在现代化成品内在质量标准的基础上，予以检验控制的时候。
         
    随着三十多年来现代化学分析技术的不断进步，中药材和中成药内在化学成分的研究手段和方法越来越多，越来越好。将研究知晓的内在成分及其测定方法用于质量控制，制定相应检验标准，在近二十年来，有了很大进展。如中国药典一九六三年版收载的中药材只有基源与外观状鉴别，中成药则仅有处方和制法，没有任何检验项目。14年之后颁布的七七年版药典大量采用了显微鉴别。从八五版药典开始，色谱、光谱技术在中药质量控制上被采用，应用的具体方法、技术、测定的成分和被要求的品种，都不断增长，最新二OOO年版药典，收载含量测定的品种已达308种。把已知的主要成分或有药效作用的成分，作为指标成分予以检测控制，这比之过去，是很大的突破和进步。但是从中医药的观点看，指标成分的控制，难以真正控制中药功效。中医辨证施治用的是药味而非某个化学成分。麻黄素和麻黄、甘草酸和甘草、人参皂甙和人参、灵芝和灵芝多糖等等在中医来看是两回事。
         
    中药的“补气”、“活血”、“温里”、“发表”、“滋阴”、“健脾”等等诸如此类的中医药功效，是药材饮片或成药方剂内含物质群的整体作用结果。此物质群的整体情况，包括所含的物质数、物质量及组成比例差异，都会对功效发生影响。中医传统上有“传方不传量”之说，意即方剂功效不仅取决于构成方剂药味，还取决于药味的绝对量及配伍比例。所以方子的组成药味可告之，但各味药的用量是技术核心秘密，不可外传。如张仲景伤寒论中的发表剂“桂枝汤”由桂枝、芍药、生姜、炙甘草、大枣等五味药组成。仅仅把其中芍药用量加倍再加上饴糖，即成为补虚散寒，温建中脏(脾胃)的补益剂“小建中汤”。所以要控制中药功效，不能只针对某一、二个化学成分，必须对方剂物质群整体予以控制。

    对药品要求“安全、有效和可控”是国际共识，也是中医药融入系统生物医学理论体系的必要条件。欧洲一直比较重视草药的医疗作用，对草药的质量控制已经采用了指纹图谱方法。德、法联合开发的银杏叶提取物EG6761是一个典范。他们在研究中发现银杏叶提取物的医疗作用是提取物所得物质群的整体作用结果。德、法联合集团的技术负责人说，EG6761提取物是一个“整体”，正是这样一种混合物保证了其所具有的治疗作用。他们进行了长期的研究，把混合物所含内酯和黄酮相互分离，则“都不具备全部提取物整体的功效”。在这一点上，和我们对中成药的疗效是物质群整体的功效这样的认识是一致的。而对于这样一个“整体”的质量控制，现在也是采用高效液相指纹图谱方法。中国科学院上海生命科学院采用高效液相指纹图谱的方法确定了双灵固本散的抗肿瘤物质群GL22，才使双灵固本散走出传统医学的窠臼，成为系统生物医学的重要治疗手段。