大黄按不同规格等级分别包装，一般使用麻袋，每件30公斤左右。有的优质品用木箱盛装。贮存于通风干燥避光处，适宜温度30℃以下，相对湿度70％－75％。商品安全水分为10％－14％。
本品易虫蛀、生霉、变色。如贮存时间过长，环境潮湿，或商品含水量偏高，则易发霉、变色。霉品初期表面无明显变化，但质松，轻泡，断面灰黑，有的出现霉斑。危害的仓虫主要有咖啡豆象、大斑螟、毒隐翅虫、四眼隐翅虫、大谷盔、赤拟谷盗、日本蛛甲、黑毛皮蠹等，多潜匿于内部蛀噬，或在表面皱褶缝隙中。仔细观察，可见蛀孔、蛀痕。
贮藏期间定期检查，若发现受潮或轻度霉变、虫蛀，及时凉晒，翻垛通风，或置50℃－60℃下烘烤1小时处理。虫情严重时，用磷化铝熏杀。大批量仓储最好采用密封抽氧充氮养护。
