中药资源以自然资源为物质基础，来源极为广博。尽管物种间的形体构造、生理机能以及生态环境千差万别，但从自然属性来讲分属于植物、动物和矿物3个范畴。也就是说，中国中药资源基本上是由药用植物、药用动物和药用矿物三大类构成的。

    1985-1989年全国中药资源普查统计，中国中药资源已达12772种。中药资源种类的统计采用物种的分类单位，因此，中国万余种中药资源实际包含了万余个物种。其中药用植物包括种以下单位，药用动物不含亚种，药用矿物以原矿物为单位。中药资源中药用植物种类最多，约占全部种数的87％；药用动物占12％；药用矿物则不足1％。

    药用植物种类：

    药用植物资源包括藻类、菌类、地衣类、苔藓类、蕨类及种子植物等植物类群。目前，中国药用植物资源有385科、2312属、11118种（包括9905种、1208个种以下单元）。藻类、菌类、地衣类同属低等植物，药用资源共计92科、179属、463种；苔藓类、蕨类、种子植物为高等植物，药用资源计划性293科、2134属、10553种。也就是说，约95%的药用植物资源属于高等植物，其中种子植物占90%以上，而藻类、菌类、地衣类、苔藓类、蕨类等孢子植物仅占8.6%。显然，种子植物是中国药用植物资源的主体。

    藻类：中国藻类植物估计有数千种其中药用藻类资源共计划处42科、53属、114种。药用藻类中较重要的是红藻、绿藻和褐藻，占种数的88％。红藻门药用植物中种数较多的科有江篱科（1属8种）、石花菜科（2属7种）、红毛菜科（2属7种）、松节藻科（3属4种）、红翎菜科（2属4种）、仙菜科（2属4种）等。绿藻门的主要科是石莼科（2属11种）和双星藻科（1属5种）。褐藻门的半数以上的药用种集中在马尾藻科（1属12种），该科也是药用藻类中最大的科。

    就目前来讲，藻类植物中药用种数最多的是海洋藻类，据报道，中国药用海藻有120种以上。海藻中已用作药材的主要有海带、昆布、马尾藻、羊栖菜、海蒿子等。药用海藻中石花菜、蜈蚣藻、海蕴，石莼、海萝。鹿角菜、裙带菜。鸡毛菜、皱紫菜。海黍子、宣藻。肠浒苔、美舌藻（鹤鸪莱）、海人草等为较常见的种类。中国70年代引入的巨藻亦可药用 。淡水藻类药用的主要有脆轮藻、普通水绵和小球藻等，陆生藻主要是念珠藻（葛仙米）和发状念珠藻（发菜）等。

    菌类：

    中药资源所涉及的菌类只限于真菌。药用真菌有41科、110属、298种，是药用低等植物中种数最多的一类。药用真菌中比较重要的是子囊菌和担子菌两个纲。担子菌纲尤为突出，药用种数约占药用真菌的90％。

    担子菌中70％的药用种集中在6个较大的科，即多孔菌科（27属74种）、口蘑科（18属45种）、红菇科（2属33种）、牛肝菌科(5属16种）。马勃科（6属13种）和蘑菇科（2属12种）。主要药用属有多孔菌属、羊肚菌属、红菇属、侧耳属等。灵芝属的植物全世界有100余种，中国有73种，是世界上灵芝种数最多的国家，海南省是中国的“灵芝王国”，有50余种。本属可药用的有7种。担子菌中常用药材主要有茯苓、猪苓、 灵芝、紫芝、雷丸、马勃、银耳等，其他还有猴头菌、云芝、竹黄、侧耳、木耳、苦白蹄、尖顶地星、鸡丛、香菇、竹荪树舌等。

    子囊菌中的药用种主要集中在麦角菌科（5属10种）、肉座菌科（4属4种）、黑粉 菌科（2属4种）。虫草属是较重要的属，中国共有该属植物58种。据报道，本属有药用价值并已利用或研究开发的有20种（包括无性型），主要有冬虫夏草、蛹虫草（北冬虫夏草）。蝉花、大蝉草等。中国台湾（22种）、广东（17种）。云南（13种）等地虫草种类较多，资源较丰富。冬虫夏草主产中国西南高海拔地区。过去完全靠采挖野生资源提供药用，货源紧张。经多年研究试验，人工培育冬虫夏草已获成功，并投入生产。属于子囊菌纲的主要药用种还有玉米黑粉菌、小麦散黑粉菌（麦奴）、谷子黑粉菌（粟奴）、麦角菌、稻曲菌、高粱黑粉菌等。药用真菌中的藻状菌纲和半知菌纲的种数很少，主要有粟白发（糠谷老）。白僵菌等。真菌植物的药用历史较久，古代本草多有收载，但种类不多，目前，药用真菌已引起广泛注意，有些种类如蜜环菌、亮菌等是近年才发掘利用。