本区位于川西、藏东分割高原以北的青藏高原东部，是青藏高原的主体部分，也是长江、黄河等的源头所在。全区地势自西向东缓缓倾斜，西部海拔4000多米，东部降至海拔3500米以下，低洼处形成大面积沼泽。本区夏凉、冬寒，为青藏高原低温中心之一；冬季风大、雪多，热量条件差；年平均温度1-3℃，7月平均气温仅10-120C，年降水量600-800毫米，自然景观主要是高寒草甸草原。本区不仅草场面积大、资源丰富，还生长有大面积的原始森林，植被种类以喜马拉雅植物区系成分为主。本区虽为海拔4000米的高原，但因受东南季风影响，入夏多小雨，草甸和灌木丛繁茂，植被覆盖面较大。因此，中药资源种类较多，蕴藏量也大。本区约有中药资源700种，其中野生药材300多种，名贵的有鹿茸，麝香、熊胆、豹骨、冬虫夏草、川贝母、黄芪、秦艽、赤芍、龙胆、大黄、丹参、羌活及党参等。藏药有洪连、独一味、山莨菪等。唐古特山莨菪、唐古特瑞香、马尿泡等为本区特有药用植物。珍贵、稀有、濒危的药用动物较多，如麝、黑熊、藏羚、金钱豹、白唇鹿、棕熊和云豹、猴等。

    以青海达口县为例来说明药用植物的自然分布。该县位于青海果洛州南部，巴颜喀拉山从境内西北绵延至东南，属高寒草甸、草场。其植物分布可分为三个类型：

    1）高山草甸，位于海拔3700-4700米的河谷谷地，分布的药用植物有红虎耳草、珠芽蓼、密花橐吾、头花蓼、火绒草、铁棒锤、唐松草、狼毒、大戟、毛莨、乳白香青和短管兔儿草等。

    2）沼泽化草甸，位于4100-4500米的河谷滩地，分布的药用植物有驴蹄草、黄花棘豆、沼生虎耳草、灯心草、酸模、星状风毛菊、唐松草和高山大戟等。

    3）灌丛草甸，位于海拔1900-4250米的高山山地、阴坡滩地。分布的药用植物有金露梅、鬼箭锦鸡儿、杜鹃、高山绣线菊、风毛菊、黄芪、棘豆、酸模、大戟、高山唐松草、铁棒锤、秦艽、羌活、马尾连、大黄、沙棘、草麻黄、甘松、马勃、湿生扁蕾及花锚等。