本区包括雪峰山以东。武夷山一仙霞岭以西。秦岭山地以北、长江中下游平原以南的广大低山丘陵区。全区由一系列东北--西南走向的雁行式排列的中山、低山和其间的一系列丘陵盆地组成。境内低山丘陵与河谷盆地交错分布，是中国业热带重要的丘陵山区。本区内有不少海拔1000-2000米的中山，主要的有湖南西部的雪峰山、武陵山；湘赣边界的罗霄山、武功山、九岭山、幕阜山；皖、浙、闽、赣之间的天目山、庐山、黄山、怀玉山、仙霞岭、武夷山，浙闽沿海自北向南的天台山，括苍山，洞宫山、戴云山等。这些山地药用植物的垂直分布带谱都比较明显。本章中药资源垂直分布一节记述了海拔1841米的黄山等药用植物垂直分布带谱。

　　江南山地气候温暖湿润，降水丰富。春季，南方海洋气团开始活跃，北方冷空气时有南下，两者常在江南交汇，造成了春雨绵绵，夏季高温多雨，秋季天高气爽，冬季比较温暖的气候。土壤以粘土发育的红壤为主。本区为典型的亚热带（中亚热带）东部山地丘陵自然景观。天然植被为典型的亚热带常绿阔叶林，主要由壳斗科、樟科、山茶科、木兰科、金缕梅科和杜英科的常绿阔叶树种组成，本区北部属华东植物区系，南部属华南植物区系。全区自北向南热带植物区系的成分不断增加，而暖温带和温带成分则逐步减少。

　　本区中药资源种类约2500种，其中药用植物约2300种、药用动物约150种、药用矿物及其他50种，基本上为亚热带种类，有少量（包括野生和栽培）热带种类，如肉桂、巴戟天、益智、儿茶及砂仁等。本区是江浙类药材的分布中心，也是湖广类药材的重点产区。野生药材面广、量大，栽培药材质优量多。传统的地道药材较多，如浙江有浙贝母、麦冬、玄参、白术、白芍、菊花、延胡索、温郁金，习称“浙八味”；安徽四大皖药（白芍、菊花、茯苓、牡丹皮）及霍山石斛、宣城木瓜等；江苏有茅苍术、苏薄荷及四小药材（小花果，小草药、小昆虫、小矿物）等；福建产泽泻、厚朴、木瓜、黄栀子、黄精、土茯苓等；江西有枳壳、枳实、鸡血藤、荆芥、车前子、茵陈、陈皮、香薷等；湖南有牡丹皮、吴茱萸、莲子、玉竹、黄精、五倍子、金果榄等；湖北有黄连、茯苓、独活、厚朴、木瓜、射干、莲子及蒲黄等。野生药材中产量大、质量好的种类有葛根、土茯苓、青风藤、狗脊、乌药、淡竹叶、栀子、虎杖，女贞子，海风藤、夏枯草、白花蛇舌草、鸡血藤、黄精、前胡、香附子、钩藤、艾叶、粉防己、石韦、益母草、野菊、海桐皮、南沙参、茵陈、香薷和天冬等。

　　在药用植物的自然分布方面，以位于江南丘陵中部。地处中亚热带常绿阔叶林南部的天目山山地丘陵区为例，亚热带成分的乔木类药用植物有枫香、山核桃、凹叶厚朴、山鸡椒，莽草、冬青、石楠、刺楸、银杏、三尖杉、粗榧、金钱松等；灌木类有闹羊花、掌叶覆盆子、庐山小檗、野山楂、枸骨、乌药、乌饭树等；草本类有狗脊、石蒜、江南卷柏、夏天无、七叶一枝花、杜衡、黄精等；岩石上生长有蛇根草、水龙骨、石菖蒲、石吊兰、滴水珠、斑叶兰、异叶天南星等阴湿草本植物；动物性药材有桑螵蛸、蝉蜕、乌梢蛇、蕲蛇、龟甲、刺猬皮、水牛角等、邻近南亚热带的浙南山地丘陵出现了一些热带成分的药用植物：乔木类如鹅掌柴、桉树、花榈木、冬青、山鸡椒等；灌木类如朱砂根、百两金、桃金娘、杜虹花、草珊瑚等；林下草本类如山姜、七里明、地胆草、胎生狗脊蕨、江浙獐牙菜等。生于沟谷地段的草本类有球花马蓝、深绿卷柏、鹿蹄草、广东石豆兰、细叶石仙桃、阴地蕨等。藤本类有瓜馥木、飞龙掌血、黑鳗藤、玉叶金花、串珠藤等，在山坡林下阴湿处分布有肾蕨、剑叶凤尾蕨、金毛狗、福建座莲蕨等。这一区域还种植了不少南药，如八角茴香、肉桂、鸦胆子、安息香、海南萝芙木、钩藤、川楝子等。动物类药材有蕲蛇、海浮石、海螵蛸、牡蛎、海马、海龙、瓦楞子等。浙闽丘陵还分布有天竺桂、南酸枣、山杜英、华杜英、细柄蕈树、建柏、白豆杉、交让木等热带成分植物；林下还分布有粗榧、阔叶十大功劳、钝叶冬青、圆锥绣球、紫金牛、九节木、山姜、南座莲蕨等药用植物。

　　本区动物性药材主要有穿山甲、蕲蛇、白花蛇等，以及蜈蚣、桑螵蛸、蝉蜕、豹骨、鹿茸、土鳖虫、龟甲、鳖甲、蟾酥、珍珠母、乌梢蛇、刺猬皮、蝼蛄、蚯蚓、蛴螬、九香虫、蝙蝠、蚂蝗等。

　　药用矿物以雄黄、朱砂、信石、石燕等最为著名，还有自然铜、磁石、石膏、云母石、钟乳石、鹅管石、滑石、炉甘石、无名异、密陀僧、胆矾、铜绿、硼砂、寒水石、禹粮石、蛇含石、赤石脂、花蕊石、白石英、紫石英、金精石、白石脂、硫黄、赭石、青矾、红粉、轻粉、黑砂、红升丹、白降丹及伏龙肝等。