长白山地坡地较平缓。由于纬度偏南，直接承受来自日本的湿气团，气候比较温暖，雨量充沛。长白山最高峰海拔2961米，周围的山地有许多平行的山脊和纵切的宽谷，一般海拔500-1000米。本区植被随着地势的升高，呈现了明显的垂直分布规律，有维管束植物1500多种，其中药用植物900多种。

    长白山的珍贵、稀有和濒危药用植物中，属长白植物区系的有红松、水曲柳、核桃楸、关黄柏、山葡萄、人参等；属南鄂霍次克植物区系的主要有长白银莲花、高山龙胆、笃斯越桔、越桔等；狗枣猕猴桃、葛枣猕猴桃、软枣猕猴桃等种类的存在，反映了长白植物区系与亚热带植物具有密切的关系。

    本区栽培的植物药材有人参、细辛、党参、平贝母、黄芪、龙胆、丹参、天麻、薏苡、白芍、黄芩、北马兜铃、北沙参、红花及金银花等。

    小兴安岭及长白山地野生药用动物种类较多，主要有马鹿、梅花鹿、原麝、东北虎、豹、黑熊、棕熊、紫貂、水獭、长白蝮蛇、蟾蜍和蛤士蟆等，其中鹿茸、豹骨、熊胆和蛤蟆油都是本区重要的珍贵药材资源。

    本区分布的药用矿物有白垩、方解石、云母、玄精石、白石英、自然铜、阴起石、花蕊石、金箔、金精石、炉甘石、青礞石、绿青、海浮石、银箔、蛇含石、滑石、硫黄、寒水石、磁石、硼砂、赤石脂、钟乳石、铅丹、石膏、扁青、鹅管石、硼砂等。