本区北起黑龙江省爱辉附近，南抵沈丹铁路稍北一线，东抵国界线，西邻松辽平原，略呈新月形。本区大部分为山岭和丘陵，北段为小兴安岭，过松花江后为长白山地，东北面为低陷的三江平原。全区基本上属冷湿型温带针阔叶混交林景观。气候比大兴安岭北部山地温和，但冬季气温仍很低，寒冷期也相当长。本区距海较近，受海洋湿润空气的影响，年降水量较高，长白山地东南侧可达1000毫米，丘陵谷地和低地一般在500-750毫米，是东北地区最湿润的地区。小兴安岭基本上是低山丘陵，纬度较高、温度较低、地面平缓，而长白山地纬度位置偏低，地势较高，自然景观的垂直分异较为明显。

    本区植物种类繁多，具维管束植物2000种以上，其中一半为东亚特有种。本区属长白植物区系，地带性植被属温带针叶阔叶混交林，区系种类构成比较复杂，是中药资源的主要分布地区。本区特产的木本药用植物有红松、紫杉、水曲柳，马鞍树（怀槐）、核桃楸、关黄柏、暴马丁香、毛榛、刺五加和刺楸等。藤本药用植物有北五味子、山葡萄、软枣猕猴桃、狗枣猕猴桃、葛枣猕猴桃、红藤子（东北雷公藤），木通马兜铃及刺苞南蛇藤等。草本药用植物有人参、长白瑞香、铃兰、二歧银莲花、北细辛、平贝母等。

    小兴安岭山区地势起伏较大，谷地宽阔，森林茂密，分布的药用植物有人参、党参、关黄柏、五味子、膜荚黄芪、平贝母、山楂、刺五加、无梗五加、龙牙?B木、木通马兜铃、辽细辛、侧金盏花、红藤子，桔梗、天麻、猪苓、龙胆、贯众、木贼、关苍术、升麻、缬草、草乌、白附子、赤芍、槲寄生、败酱、紫菀、远志、东北天南星、芡实、穿龙薯蓣、细叶地榆、铃兰、藜芦、山丹百合、卫矛、白鲜、落新妇、白花延龄草、威灵仙、大叶小檗、齿瓣延胡索、东北延胡索、越桔、笃斯越桔、玉竹、手掌参、轮叶百合、白薇、山杏、东北扁核木和野刺玫等。