台湾的史前文化源于中国大陆，同属一脉，唯其独居东隅，开发较晚，明代以前，台湾社会生产力贫乏，医疗卫生十分落后。虽然当时高山族同胞在实践中积累了一定的涉及内、外、妇、儿等科医疗保健经验，但仍属原始阶段，没有较完整的医疗体系。

　　中国传统医学传入台湾的时期据文献记载最早的是明末永历年间（公元16470-1661年），去台避难的浙江都县沈光文，寄寓在目加溜湾社时，曾从事教读，兼以医药治病。清代官修谱府县志中还载有沈诠期、徐恢钻、吴廷庆、翁同敏、邱益琼、卓梦采等人亦因种种原因流落至台，从事教学及医药济世。他们在实践中，不断发掘台湾的中草药，传授、普及中医药知识，丰富了祖国医学宝库，使中医药事业在台湾得到发展。至清.光绪二十三年底（1897年），握统计，全台从事中医药工作者共有1070人，其中博通医书、讲究方脉有良好声誉的医家29人；以儒学兼施医者91人；自称持有祖传秘方的世医97人；稍有文字素养、从医学传习若干方剂者829人。

　　日本占领台湾之后，光绪二十七年（1901年），台湾地区举办中医考试1次，申请应考者2126人。考试结果：及格1097人；未经考试即给行医许可证者650人；考试不及格予以同情许可证者156人，合计发给执照1903人。此后40多年内，台湾不再举办中医考试，亦不再发许可证。至1945年日本投降，台湾光复，特有中医师业务许可证者，仅存数10人。台湾中医药频临消亡境地。