上海中药创新研究中心在科技部支持下，由中心主任、原科技部副部长惠永正主持，从2000年5月开始中医药信息智能化研究项目。经过近二年的努力，中心已初步建立了一个由多个数据库组成的中医药信息库系统，为传统中医药与现代药物研究结合提供了一个领先世界的数据平台。4月19日，上海中药创新研究中心与美国耶鲁大学的hytoCeutica公司签约，合作开发世界一流面向国外主流医药市场的产品。
　　
　　已有5000年历史的中医药，近年来在国际上日益受到重视，然而由于缺少能把传统中医药经验与现代化学药物知识和生物技术相关连的系统，大大影响了中医药的现代化研究。

　　据惠永正主任介绍，中医药信息的智能化研究，是一个介于中医药、生物医学、信息科学和化学等多学科的交叉性课题，是把中医药丰富浩瀚的经验积累用现代数据库方法组织起来，建立起一个功能齐全和相互关联的信息库，并用信息技术从中挖掘信息，从分子水平来认识中药，从而产生新的生长点，最终能借助这个平台，从天然植物药中开发研制出创新药物。该信息库已收集了中西医描述的20大类、1200种疾病数据；收录了1950年以来中国出版发行的中医杂志中发表的论文中有临床医案或治疗效果数据的处方；近万种中药植物药的命名、性味、归经、形态、产地、药理、临床应用和化学成分等数据项；9500个中药中含有的化合物，包括它们的二维和三维结构信息；与149种疾病相关的蛋白质序列与相关方剂和相关中药关联的信息。系统的主要特点是把各个数据库根据知识的关联串联起来，即具有类似于生物信息库的结构，从而为中药现代研究开拓新的思路，为研制新药提供强有力的工具。